La Jefatura de Estudios es el órgano encargado de organizar todas las actividades académicas del centro. Desde la Jefatura se preparan los horarios de alumnos y profesores, se lleva el control de faltas de asistencia, se corrigen las faltas de convivencia, se hace el seguimiento del grado de cumplimiento de los horarios. Además es el órgano sobre el que recae la responsabilidad de organizar las tutorías y dirigir los cometidos de las mismas. Es sin duda el “alma mater” del centro. Por esta Jefatura pasan todas y cada una de las incidencias que ocurren en el instituto. Como el centro tiene una complejidad organizativa  muy acusada, la Jefatura actual está gestionada por cinco profesores:

      Doña  Carlota Aldayturriaga, Jefe de Estudios
      Don Rafael Angulo Fernández,
Jefe de Estudios Adjunto de Secundaria
      Doña Mª Luz Rodríguez Pindado,
Jefe de Estudios adjunto de Bachillerato
      Don Jorge Anglada Gomila,
Jefe de Estudios de Régimen Nocturno
      Don Eduardo Ruiz Eguiluz,
Jefe de Estudos de Régimen Distancia