Es la dependencia del Instituto donde se realizan todos los trámites administrativos relacionados con los profesores, los alumnos y el personal no docente. Desde la Secretaría se procede a la matrícula de los alumnos, al traslado de expedientes, a la confección de actas y boletines de notas, a la cumplimentación de libros de escolaridad, a la gestión económica y a la atención del público en general. También aquí se guardan y custodian  todos los documentos de alumnos y profesores que han pasado por el centro. Este trabajo lo llevan a cabo cuatro administrativas que en este momento son:

 

Doña Mercedes Castillón Ridruejo (con cargo de responsable de la oficina)
Doña Mª Carmen Barragán Cárdenas
Doña Carmen Amparo Moro Calvo
Doña Miriam Martínez Estebas

La responsabilidad directa es del Secretario del centro que en la actualidad es D. Manuel Cojo, profesor de Lengua  Castellana y Literatura.